中小企业网站搜索引擎优化的弊端主要包括以下几点：
一、盲目追求美观，在页面内出现了过多的动画和图片
1、 很多网站，因为企业网站本身的内容比较少，好多网站采取了通过视觉冲击来达到，让受众者耳目一新的感觉
2、 logo采用flash，导航采用动画,在网页的顶部扣一个大帽子，整个帽子就是一幅画，嫣然很漂亮的样子
3、 这些因素，都给搜索爬虫一种认识，这里是一个动画，这边是一个图片，而且很可以，图片连个备注都没有，robot只好说:我不知道这里都些什么东西。
二、依然采用较为过时的table网站架构，网站表现的样式和内容没有达到很好的分离，冗余代码较多;网址没有考虑静态化。
1、div+css的较大的作用，就是能够很好的将网站中用来表现的样式和网页内容能够很好的分离出来，从而降低网页的信噪比，使网页内容更加清晰。不过，这也难怪，现在在做网站建设的技术人员中，用table架构的人比用div+css的人多出来很多，所以就产生了，相对比较多的table架构的网站。冗余的代码，在很多的网站里，都能够找到。
2、用一个可以简短的语句就可以实现的功能或者样式，被采用复杂的过程。很多人不清楚，网页语言中的默认的属性，而往往把默认的属性也给标了出来，增加了代码的繁琐性。
3、 html语言没有规范使用。
H1针对所有的搜索引擎，因为百度的内核是根据GG的一些规则写的，所以H1对中文搜索引擎优化也同样适用
三、网站内容少是大多数中小企业网站存在的问题
作为中小企业，网站的内容总是没有那么多，这也是难怪，不大点的一个小厂，小公司，哪儿有那么多的事情天天发生呢？
四、网站缺乏管理人员，没有对网站进行及时的更新
很多企业的网站，直达做上去之后，就再也没有进行过任何更新，没有任何的变化。“死水是养不出鱼来的”。
五、中小企业对seo的认识
误区：许多打算做优化的人，一般心态是：我的网站正在建设中，等网站做好了上线之后，再拿过来优化一下。
网站在建设初期，就应该考虑seo的因素，把seo的多个细节考虑进来，因为“亡羊补牢”毕竟不如“未雨绸缪”更好一些。当然，在seo一步步走到今天，很多的网站建设公司也在逐步的把seo考虑进去，把搜索引擎优化做市场拓展又一个新的买点，这是好事，对于中国网站的整体质量的提高将会有很大的促进。